Kinase Classification:      Asp-Based PTP      FCP

※ FCP family introduction

    FCP/SCP phosphatase belongs to a family of phosphatase which uses an Asp nucleophile for catalysis. FCP/SCP is characterized by its phosphatase activity towards the CTD of the largest subunit of RNA polymerase II (1). At least seven members have been identified in human genome and FCP/SCP phosphatases share a conserved catalytic signature, which is known as DXDXT/V (2). Family member FCP1 is conserved among all eukaryotes and plays a important role in cell survival in budding and fission yeasts. SCP1 preferentially dephosphorylate Ser5 in CTD domain of RNA polymerase II and play a role in the regulation of gene expression by controlling the transition from initiation/capping to processive transcript elongation (3). In addition, SCP1 also act as a key regulator that functions in silencing neuronal gene expression (4).

Reference
1. Shi, Y. (2009) Serine/threonine phosphatases: mechanism through structure. Cell, 139, 468-484. PMID: 19879837
2. Moorhead, G.B., Trinkle-Mulcahy, L. and Ulke-Lemee, A. (2007) Emerging roles of nuclear protein phosphatases. Nat Rev Mol Cell Biol, 8, 234-244. PMID: 17318227
3. Yeo, M., Lin, P.S., Dahmus, M.E. and Gill, G.N. (2003) A novel RNA polymerase II C-terminal domain phosphatase that preferentially dephosphorylates serine 5. J Biol Chem, 278, 26078-26085. PMID: 12721286
4. Yeo, M., Lee, S.K., Lee, B., Ruiz, E.C., Pfaff, S.L. and Gill, G.N. (2005) Small CTD phosphatases function in silencing neuronal gene expression. Science, 307, 596-600. PMID: 15681389


Asp-Based PTP FCP in eukaryotes:

  Ailuropoda melanoleuca (7)  Anolis carolinensis (8)  Arabidopsis lyrata (27)
  Arabidopsis thaliana (26)  Bos taurus (7)  Brachypodium distachyon (16)
  Brassica rapa (32)  Caenorhabditis elegans (5)  Callithrix jacchus (8)
  Canis familiaris (8)  Cavia porcellus (8)  Chlamydomonas reinhardtii (8)
  Choloepus hoffmanni (2)  Ciona intestinalis (5)  Ciona savignyi (6)
  Cyanidioschyzon merolae (6)  Danio rerio (12)  Dasypus novemcinctus (2)
  Dipodomys ordii (3)  Drosophila melanogaster (9)  Echinops telfairi (2)
  Equus caballus (8)  Erinaceus europaeus (3)  Felis catus (8)
  Gadus morhua (8)  Gallus gallus (4)  Gasterosteus aculeatus (11)
  Glycine max (28)  Gorilla gorilla (7)  Homo sapiens (8)
  Hordeum vulgare (15)  Ictidomys tridecemlineatus (8)  Latimeria chalumnae (7)
  Loxodonta africana (8)  Macaca mulatta (9)  Macropus eugenii (3)
  Meleagris gallopavo (6)  Microcebus murinus (2)  Monodelphis domestica (9)
  Mus musculus (8)  Musa acuminata (18)  Mustela putorius furo (8)
  Myotis lucifugus (7)  Nomascus leucogenys (7)  Ochotona princeps (3)
  Oreochromis niloticus (12)  Ornithorhynchus anatinus (6)  Oryctolagus cuniculus (9)
  Oryza brachyantha (16)  Oryza glaberrima (18)  Oryza indica (18)
  Oryza sativa (19)  Oryzias latipes (12)  Otolemur garnettii (8)
  Pan troglodytes (8)  Pelodiscus sinensis (7)  Petromyzon marinus (9)
  Physcomitrella patens (11)  Pongo abelii (8)  Populus trichocarpa (22)
  Procavia capensis (2)  Pteropus vampyrus (4)  Rattus norvegicus (8)
  Saccharomyces cerevisiae (5)  Sarcophilus harrisii (8)  Schizosaccharomyces pombe (5)
  Selaginella moellendorffii (82)  Setaria italica (17)  Solanum lycopersicum (17)
  Solanum tuberosum (11)  Sorex araneus (2)  Sorghum bicolor (17)
  Sus scrofa (8)  Taeniopygia guttata (5)  Takifugu rubripes (11)
  Tarsius syrichta (1)  Tetraodon nigroviridis (11)  Tupaia belangeri (1)
  Tursiops truncatus (5)  Vitis vinifera (16)  Xenopus tropicalis (8)
  Xiphophorus maculatus (12)  Zea mays (22)